而在残余官军想要继续负隅顽抗的舱室当中，用黑火药土造的爆炸物或是特制的毒烟球，也能够起到较好的清理效果；而大大避免了在狭窄之处，不断添油式血战所带来的不必要损伤和牺牲。因此，完全可以说这是一场知己知彼的不对称优势下的战斗。
因此最后太平水军的损失不过是大小十七条船，大多数是被官军准头不高的投射石块给砸伤、砸坏，或是被集中攒射的火箭点燃帆缆和上层建筑，而不得不就近冲摊靠岸搁浅以自救的结果；
荆州毕竟是自古以来造船历史悠久的水师发源地之一，又有湘中群山之地的大木良材为原料，因此造出来的船也是以坚实耐用称著一时；故而就算是这个搁浅的船只，也有一顶概率和可能性被重新修复，或是拆卸下可以利用的部分来继续造船。这样的话具体损失指标还可以继续下调一些。
由此在水战产生的具体伤亡约有五六百人左右，差不多占了整体水师力量的十分之一而已；其中直接阵亡者不及百人，大都是在靠近官军战船的对射过程当中造成的。主要是因为不吝惜火器的使用，在后续的近战和拼杀过程当中的损失，反倒是几乎可以忽略不计。
最后粗粗估计直接焚烧，击毁和撞沉的官船，差不多达到了一百多艘，而被击伤和受损、士气崩坏而逃走的官船大概是这个数字两倍还略多一些；最后也俘获了至少七八十条各有不同程度损伤的官军战船，而且都是体型较大而转向不便，没来得及跑掉和脱身的艨艟和斗舰之属。
本来这个数量还会更多一些。只是在这个逐一接手和操使的过程当中，因为太平水军的人手不足和缺乏相应经验的失误，又陆陆续续的翻沉和失控飘走了十几艘；才把剩下的俘获都被控制住而行驶起来，晃晃悠悠慢吞吞的靠到岸边去下锚泊住。