各分部的旗帜亦具有极其重要的作用。这是他们存在的标识。各营、各队、各什、各伍等，往往即使牺牲到最后一人，也要死死保住本军的旗帜。因为上级军官或主将指挥，亦不可能细察到每一分部，只能观览旗帜，确定其位置和状态。在他们眼里，旗帜在，该分部犹在，旗帜失，这一分部就算不存在了。本朝太宗更是规定，“凡失旗鼓旌节者，全队斩！有功准赎。”故而某部若军旗被夺，将士们往往拼了命也要再抢回来。
指挥更为复杂。
旗帜有各种各样的不同颜色、不同级别的旗帜，有各种各样的不同挥动手法，还有各种不同的应用场合。
应旗。
上面说到，中前左右后五军，分别以黄红蓝白黑五色标识。主将要调动某军，升某色指挥帜，某军见到须立刻竖起